亳州市中医院起始于1956年，成立于2019年4月，是一所集中医医疗、教学、科研于一体的三级甲等中医医院，位于华佗故里、药材之乡亳州，是国家中医特色重点医院、省级区域医疗中心及省级中医医疗中心建设单位、安徽省中医药文化宣传教育基地，是安徽中医药大学教学医院、安徽中医药大学第一附属医院亳州分院。2023年，医院门急诊人次55万，出院人次4.2万，开展手术1.02万例。
医院坐落于亳州市谯城区北一环与魏武大道交叉口。医院总占地135亩，建筑面积约18万m²（含二期工程5.9万m²），设临床科室36个，医技、医辅科室12个，开放床位1000张。现有职工1100人，其中高级职称206人。
目前拥有国家中医药管理局农村医疗机构中医特色优势重点专科1个，省级重点专科专病7个、市级重点专科10个、市级临床重点专科4个。全国老中医药专家学术经验继承工作导师2名、江淮名医2名、安徽省名中医3名、安徽省基层名中医1名，市级名中医及优秀人才10余名，各级各类名老中医工作室10余个。
医院立足于亳州市“世界中医药之都”的发展定位，以人民群众健康为中心，始终秉承“群众满意，医患关系更和谐；职工满意，员工更具幸福感；社会满意，彰显责任与公益”的使命，不断提升核心竞争力，朝着全国知名、全省一流的中医院努力奋进。